W ludzkim ciele znaleziono super rozprzestrzeniony wirus, o którym nie wiedzieliśmy do dziś

Naukowcy właśnie ogłosili odkrycie nowego, niezwykle powszechnego wirusa, który żyje w ludzkich bakteriach jelitowych. Nazywa się „crAssphage” i jest prawie sześciokrotnie bardziej powszechny niż wszystkie inne wirusy bakteryjne łącznie. Ale jak mogliśmy go nie zauważać tak długo?

Powodem, dla którego nie znaleźliśmy wcześniej crAssphage, jest to, że nie wiedzieliśmy, że powinniśmy go szukać. To znaczy.

Chociaż nowe technologie sekwencjonowania stają się coraz szybsze i tańsze, nadal mają jedną słabość: są dobre w znajdowaniu rzeczy, o których już wiemy, ale nie są dobre w znajdowaniu nowych organizmów. Kiedy naukowcy badają próbkę organiczną, otrzymują zupę z fragmentów DNA wszystkich żywych istot związanych z tą próbką - bakterii, wirusów i samej osoby. Następnie te fragmenty muszą być zebrane w sekwencje, które możemy zidentyfikować. Jeśli znajdziemy łańcuch specyficzny dla genomu określonej bakterii, oznacza to, że znaleźliśmy tę bakterię w próbce..

Problem polega na tym, że jeśli nie znamy jeszcze sekwencji nieznanego nam wirusa, nie możemy go wykryć za pomocą tej techniki. W rzeczywistości autor nowego badania crAssphage, Bass Datil, donosi, że są one nieznane prawie 75 procentom sekwencji DNA w badanych próbkach..

Zespół Datila był w stanie znaleźć nowego wirusa przy użyciu zupełnie innego podejścia opartego na prostej idei: fragmenty, które znajdują się wielokrotnie w tej samej próbce, są bardziej prawdopodobne, że będą częścią tego samego genomu. Wykorzystali technikę tak zwanego składania krzyżowego, aby zidentyfikować jedną taką grupę powtarzających się sekwencji w próbkach pobranych od 12 osób. Następnie zebrali te sekwencje w jeden genom..

I dostali dokładnie to: wirus crAssphage, nazwany na cześć techniki krzyżowania, która doprowadziła do jego odkrycia. Odkryli, że crAssphage żyje wewnątrz Bacteroides - wspólnej grupy bakterii, które żyją w naszych jelitach..

W wyniku badań zespół znalazł crAssphage w 75% sekwencji jelitowych ludzi w USA, Europie i Korei Południowej. Nie wiemy jeszcze, co dokładnie robią te fagi w naszych jelitach, ale zdecydowanie odgrywają pewną rolę w naszym jelitowym ekosystemie mikrobiologicznym..

I wreszcie interesujący fakt: naukowcy obliczyli, że w naszym ciele jest około 100 razy więcej cząstek wirusa niż w rzeczywistości ludzkie komórki. Mamy więc jeszcze dużo pracy, aby dowiedzieć się, kim naprawdę jesteśmy..